Az ECONUTRI általános célkitűzése olyan természetalapú, újszerű megoldások optimalizálása, validálása és bemutatása, amelyek egy holisztikus koncepcióba illeszkedve hozzájárulnak a NO3-N és a P kimosódásának csökkentéséhez, az ammónia elpárolgása révén a nitrogénveszteségek ellenőrzéséhez, valamint a mezőgazdasági ágazatból származó üvegházhatású gázok kibocsátásának mérsékléséhez, beleértve a növénytermesztést és az állattenyésztést is.

E cél elérése érdekében az ECONUTRI további célja ezen új technológiák elterjesztése és szélesebb körű alkalmazása, valamint az uniós mezőgazdasági termelők és tudósok támogatása képzés és oktatás révén a természetalapú tápanyag-gazdálkodási eszközök alkalmazásához, amelyek javítanák a levegő, a talaj és a víz minőségét Európában és Kínában, és hozzájárulnának a globális éghajlatváltozás mérsékléséhez.